Pikachurin

Fra Wikipedia, den frie encyklopædi
Gå til: navigation, søg
EGFLAM
Identifikatorer
Aliaser EGFLAM, AGRINL, AGRNL, PIKA, EGF like, fibronectin type III and laminin G domains
External IDs MGI: 2146149 HomoloGene: 65044 GeneCards: EGFLAM
Ortologer
Art Menneske Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_182801
NM_001205301
NM_152403
NM_182798
NM_182799

NM_001289496
NM_001289498
NM_178748

RefSeq (protein)

NP_001192230
NP_689616
NP_877950
NP_877953

NP_001276425
NP_001276427
NP_848863

Location (UCSC) n/a Chr 15: 7.21 – 7.4 Mb
PubMed-søgning [1] [2]
Wikidata
Vis/Rediger Menneske Vis/Rediger Mus

Pikachurin, også kendt som AGRINL og EGF-like, fibronectin type-III og laminin G-like domain-containing protein (EGFLAM), er et protein der i mennesker kodes af EGFLAM genet[3][4][5], på kromosom 5.

Pikachurin er et dystroglycan-interagerende protein der har en essentiel rolle i den præcise interaktion imellem fotoreceptorer og ribbon synapser og de bipolare dendriter[4]. En ukorrekt binding imellem pikachurin og dystroglycan er forbundet med en type muskelsvind, der ofte involverer anormaliteter i øjnene[6].

Opdagelse og nomenklatur[redigér | redigér wikikode]

Pikachurin er et ekstracellulær matrix-lignende retina protein, der først blev beskrevet i 2008 i Japan af Shigeru Sato et al., og navngivet efter Pikachu, en art fra Pokémon universet.[4]. Navnet på dette "adrætte" protein var inspireret af Pikachu's "lynhurtige bevægelser og chokerende elektriske effekter".[7]

Pikachurin blev oprindeligt identificeret i en microarray analyse af genekspression profiler af retinaens wild-type og Otx2 knockout mus. En Real-time PCR analyse blev anvendt til at bekræfte at Otx2 regulerer ekspressionen af pikachurin, hvilket blev klart, siden der var et fravær af pikachurin ekspression i retina fra Otx2 knockout mus.[4]

Se også[redigér | redigér wikikode]

Kilder[redigér | redigér wikikode]

  1. ^ Human PubMed Reference:. 
  2. ^ Mouse PubMed Reference:. 
  3. ^ Entrez Gene: EGF-like. Hentet Januar 2018. 
  4. ^ a b c d "Pikachurin, a dystroglycan ligand, is essential for photoreceptor ribbon synapse formation". Nature Neuroscience 11 (8): 923–31. Januar 2018. doi:10.1038/nn.2160. PMID 18641643. 
  5. ^ "[Model of aberrant DNA methylation patterns and its applications in epithelial ovarian cancer.]" (på Chinese). Zhonghua Fu Chan Ke Za Zhi 44 (10): 754–9. Januar 2018. PMID 20078962. 
  6. ^ "Post-translational maturation of dystroglycan is necessary for pikachurin binding and ribbon synaptic localization". The Journal of Biological Chemistry 285 (41): 31208–16. October 2010. doi:10.1074/jbc.M110.116343. PMID 20682766. 
  7. ^ Levenstein, Steve (2008-07-24). Lightning-Fast Vision Protein Named After Pikachu. Inventor Spot. Hentet 2008-07-29.